El gobierno nacional estableció la enseñanza media diversificada por decreto No. 1962 del 20 de noviembre de 1969, firmado por los doctores Carlos Lleras Restrepo, como presidente de la república y Octavio Arizmendi Posada, como ministro de educación.
El INEM de Pasto se comenzó a construir a principios de 1969 en los terrenos que el gobierno departamental compró a la junta directiva del Hospital San Pedro, al occidente de la ciudad sobre la avenida Panamericana; así también, la gobernación del departamento adquirió la granja Betania para las prácticas agropecuarias. Esta hermosa granja está situada a 7 km del instituto, al sur este de la ciudad.
El INEM de Pasto ha sido considerado como uno de los establecimientos educativos más importantes del país por su enseñanza diversificada, por la calidad de los programas de estudio, por los recursos didácticos, por su hermosa planta física y por los servicios escolares bien establecidos.
El INEM de Pasto marcó un hito en el sur de Colombia, por la influencia de su filosofía y pedagogía en el campo educacional; por la calidad de sus educadores reflejada en la formación de sus alumnos y por la solución a múltiples necesidades educativas.
En la actualidad el INEM tiene como rectora encargada a la Magister Nylce Marien Erazo Bolaños y alberga más de 3000 estudiantes repartidos en cinco modalidades: académico, agropecuario, comercial, industrial y promoción social.

En el año de 1985 un grupo de docentes y administrativos deportistas, crean el club deportivo INEM de Pasto (CDIP), con el propósito de practicar deporte y representar a la institución educativa en certámenes de carácter regional y nacional. Es así como en el mismo año, comienza su participación en los juegos nacionales de la confraternidad Inemita que en aquella época se realizaba por zonas. El 14 de noviembre de 1990, legaliza su constitución mediante personería jurídica número 1136.
Los juegos nacionales de la confraternidad se realizan año tras año en cada una de las ciudades de Colombia en donde existe un INEM o un ITA. Para la participación en este evento los socios del club realizan un aporte mensual y actividades que les permiten recolectar fondos, que garantizan la representación de nuestra institución, en los mismos.
El INEM de Pasto fue sede de los XV juegos de la confraternidad y se vio engalanado con la Visita de los INEM e ITAS de Colombia en el año de 1995, quienes reconocieron la adecuada organización, manifestaron su admiración por las instalaciones, catalogando nuestro colegio como uno de los más bonitos del país y se destacaron las actividades culturales presentadas; ratificando de esta manera una de las fortalezas de Nariño. En ese año el club obtuvo el segundo lugar en la puntuación general que define el gran campeón, hazaña que repite en los XXIX juegos realizados en la ciudad de Cúcuta en el 2009 y luego en la ciudad de Armenia en el año 2019
Entre los triunfos obtenidos por el club deportivo de Pasto, cabe destacar el premio de la Confraternidad otorgado a la delegación que demuestra mayor vocación de servicio, mejores relaciones interpersonales y juego limpio obtenido en los XXVI Juegos Nacionales realizados en Barranquilla.
En la actualidad el club deportivo INEM de Pasto está conformado por 36 asociados que representan a la institución educativa en certámenes de carácter nacional y regional en deportes de conjunto como baloncesto masculino, voleibol masculino, fútbol, bolos y mini tejo en las dos ramas, y deportes individuales: atletismo ajedrez y natación, como también en actividades culturales: danza y canto
El club deportivo de Pasto cuenta con una Junta Directiva que se elige por un periodo de cuatro años conformada en este momento por Jesús Mesías, presidente; Ruth Velasco, secretaria; Alicia Yépez, Fiscal; Luz Marina Zúñiga, Tesorera y como vocales están los profesores Jairo Bolaños y Martin Castro.
Representar a la institución educativa INEM- Pasto en todas las versiones de los juegos nacionales y en campeonatos regionales es un ejemplo de pundonor y espíritu deportivos para estudiantes, colegas y padres de familia.